堇川奈奈子（雪野五月 配音）是一名十三岁的天才作家，某日，她来到中国香港参加签售会，却意外遇到了恐怖袭击活动，在导游米歇尔（菊地祥子 配音）和玛姬（平田宏美 配音）的保护下，奈奈子幸运的捡回了一条命。
然而，事件并没有就此结束，奈奈子一行人发现，这场看似偶然的恐怖袭击活动，竟然是针对奈奈子而来。与此同时，奈奈子亦收到了恐吓信，信中人预言将攻击奈奈子的签售会现场，誓要让奈奈子魂断中国香港。米歇尔、玛姬和她们的妹妹阿尼（斋藤千和 配音）成为了奈奈子的保护者，在保护奈奈子的同时，三人亦要查出谁才是幕后真凶，以及他们的真实目的究竟为何。
比现代稍微未来一些。伟人军团“人类淘汰作战”事件发生数年后。中国香港某条街上有一家侦探事务所。其名为“三姐妹侦探社”。在那里的三个姐妹为了解决与书有关的事件而日夜活动着。她们的名字是阿妮达、玛姬和米雪儿。除了无比喜欢书的长女米雪儿、次女玛姬之外，连最讨厌书的末妹阿妮达，实际上都拥有“纸使”的特殊能力。降临到她们身上的事件是……？ 每集列表
