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第一部 无印篇
《神奇宝贝》（Pocket Monsters）共分为关都地区石英联盟、橘子群岛橘子联盟、城都地区城都联盟三篇，其中城都联盟还包括了一小段漩涡列岛大赛的故事。在橘子群岛时，小刚留在内木研究所，换小建和小智、小霞一同旅行，直到城都联盟，才又由小刚回锅。该系列简称为“无印”（因没副标题得称）。
大部分观众以为，《神奇宝贝》只有275集（这里指由石英篇到城都篇一般TV版），实际上神奇宝贝有276集，中国台湾的中视及中国香港的无线电视没有引进第38集“电脑战士3D龙”，因为日本在播出第一年（1997年）的12月16日，许多日本观众（青少年以下观众居多）因看了这集动画而引发光敏性癫痫送医，造成一阵大轰动，史称3D龙事件。原因就出在那集皮卡丘从3D龙身上跳出来，对迎面而来的导弹使出电击绝招，导致导弹爆炸发出强烈的闪光，红色和蓝色的光快速替换，如果一直盯着萤幕看的话，就可能会引发所谓的光敏性癫痫。这次的事件让神奇宝贝停播了一段时间，不过在日本观众热烈的反应及支持下，隔年4月16日终于复播了，但当地收视率大跌，并且制作公司也对制作动画的规则重新作了讨论，避免以后再发生类似的事故。而之后这集也被日本官方冻结，也导致3D龙和其进化型系列再也没出现在动画上。
第二部 超世代
后来，为了因应电玩GBA版（红宝石、蓝宝石版）的推出，精灵宝可梦于2002年11月21日播出《精灵宝可梦 超世代》（Pokémon Advanced Generation）系列。在城都联盟结束后，小霞跟小刚因为各自有事而和小智告别，小智为了重新出发，于是只带着皮卡丘前往丰缘地区，在那里认识了新人训练家小遥和其弟弟小胜，后来小刚重新加入，于是四人展开全新的冒险，在传统故事上保持角色互动的新意。
《精灵宝可梦 超世代》共分为丰缘地区丰缘联盟及关都地区对战开拓区两篇，和前面的剧情不一样的就是，故事变成了两个主线，小智为了参加丰缘联盟，努力挑战道馆，丰缘联盟结束后，则改挑战故乡关都地区新设的对战开拓区，而小遥则以成为协调训练家努力，挑战各地的华丽大赛，取得缎带勋章，好参加大型庆典，两人都为了达成各自的目标，与宝可梦一同奋斗。全新的比赛内容在支持者间得到好评，使之在系列往后有所延续。
第三部 钻石&珍珠
2006年秋季，为配合电玩NDS版（钻石、珍珠版）的上市，动画同步推出全新的系列《精灵宝可梦DP 钻石与珍珠》（Pokémon Diamond & Pearl）。对战开拓区篇结束后，小遥为了挑战城都地区的华丽大赛和小智告别，小刚也因为道馆有事而回去了，小智则受到了小茂的激励，独自一人带着皮卡丘和偷偷跟来的长尾怪手前往新的地区神奥地区。新登场的女主角小光，其蓝本取自于电玩NDS版（钻石、珍珠版）的女主角。另外于2007年，为庆祝电视版播映十周年，东京电视台曾多次播映一小时特别篇（即连续播映两集）。
在《精灵宝可梦DP 钻石与珍珠》中，新人训练家小光为了成为顶尖的协调训练家，而从双叶镇来到了位于真砂镇的山梨研究所领取宝可梦。而同一时间，小智也抵达了神奥地区，并在那里和为继续宝可梦培育家（饲养家）修行而前来的小刚再度会合。在因缘巧合下，小光救了小智的皮卡丘并把火箭队打飞，三人于是结伴旅行，展开了在神奥地区的冒险。故事和《精灵宝可梦 超世代》一样是有两个主线：小智为参加神奥联盟，挑战道馆；小光则为成为顶尖协调训练员而参加华丽大赛及华丽大型庆典。本作和以往不同的是小光的戏份大幅增加，于其比赛中经历比其他女主角更多高低起跌，也有更多需要单独应对的剧情处境，戏份可说是第一个有办法和小智相提并论的。
第四部 超级愿望
第一季
而后于由于任天堂于2010年推出NDS版全新作（黑、白版），动画也跟着推出新作，新作名为《精灵宝可梦 超级愿望》（Pokémon Best Wishes！），于2010年9月23日开始播映，在结束了神奥地区的旅程后，小智与妈妈和大木博士一同乘飞机前往合众地区。在那里，小智结识了带着牙牙的少女艾莉丝，及宝可梦酒侍兼道馆馆主天桐，三人于是一同展开在合众地区的旅程。艾莉丝的蓝本是取自电玩“精灵宝可梦白版”的第八道馆训练家（黑版2、白版2则成了冠军），动画则设定为以成为龙之大师为目标的少女 动画的角色成长设定的还不错 也是目前唯一会超能力的女主角。原本担任搞笑恶役的火箭队两人一猫组，在此作改变形象，成了认真的反派角色，并且秘密地执行神秘任务，为往后的剧情埋下了一些谜样的伏笔。而此作恢复为只有一个主线──小智为参加合众联盟而挑战道馆。
第二季
随后于2012年夏季，为配合电玩NDS版（黑版2、白版2）的上市，动画也正式进入第二季。在第二季中，除了原班人马外，更请回了前作的女主角小光和神奥冠军竹兰回来助阵，不仅许多第一季没有出现的旧宝可梦纷纷登场，同时更加入了“幻之宝可梦”美洛耶塔作为小智等人的伙伴，并且增添了新的主轴—火箭队对美洛耶塔的阴谋、世界锦标赛及合众联盟，为新一季带来了不一样的风气。
之后于2013年，在合众联盟结束后，动画又另外推出了两个第二季的新章节“Episode N”和“Da！”（杰可罗拉冒险！）章，“Episode N”是以游戏中的超人气角色N及反派等离子团的阴谋做为主轴所展开的故事。尽管在游戏（黑、白版）中N是偏向反派定位的角色，不过在动画中更多是做为较为正向的角色。另外原先于前一章结束任务的火箭队两人一猫组亦再次回归，并再次结合其前几部的形象，退场时会说“好讨厌的感觉”。而在“Da！”章，小智一行人告别了合众地区，打算搭船回到关都地区，顺路经过了杰可罗拉群岛，在那里遇见了很多宝可梦及新鲜或怀念的事，也为接下来的《精灵宝可梦XY》做了缓冲。
第五部 XY,XYZ
第一季, XY
2013年秋季，精灵宝可梦电玩进入了全新的3DS纪元（X、Y版），动画亦再次推出全新的系列《精灵宝可梦XY》（Pokémon XY）。告别了艾莉丝与天桐，这次小智在“Da！”章结识的记者三色堇带领下，前往卡洛斯地区，在那里他邂逅了天才发明少年，同时也是道馆馆主的希特隆、以及他的妹妹柚丽嘉、和小时候曾有一面之缘的少女莎莉娜，并与他们一同展开在卡洛斯地区的冒险。和以往的女主相比，莎莉娜的设定有些不同，除了以前曾和小智见过面外，甚至还是继小霞以来再次对小智拥有好感描述的女主，加上开播以来深入刻划人物性格的剧情及高品质的作画，尽管收视率初期没预想的高，仍受到观众不少正面评价。其冒险地图“卡洛斯地区”是以法国做为蓝本，因此多处场景皆是取材自法国实地场景。此作从中段开始再次分为两个主线：小智为参加卡洛斯联盟而挑战道馆，而莎莉娜则以宝可梦表演家为目标参加三冠卫星赛。
第二季, XYZ
在《精灵宝可梦XY&Z》动画中，首次大幅增加“传说宝可梦-基格尔德(Z)”的动画原创剧情，也首次在动画中出现正统游戏中未出现的宝可梦型态变化(牵绊变身)，更是替主角小智原创了一只型态差异的宝可梦小智版甲贺忍蛙，也是在游戏中未曾出现的宝可梦。
第六部 太阳&月亮
《精灵宝可梦 太阳与月亮》简称日月，内容为主角小智留在家中的宝可梦魔墙人偶在抽奖活动抽中大奖，一家人而前往阿罗拉地区度假。后来小智就读宝可梦学校，并暂居库库伊博士家里，在此认识了洛托姆图鉴和许多就读宝可梦学校的伙伴，如卡奇 水莲 玛奥 马玛内 莉莉艾。并和他们一起加入究极防卫队，让究极异兽回到原本的世界。在阿罗拉地区得知地区型态与Z纯晶/手环，而主角小智也获得一只卡璞·鸣鸣给的Z手环。本作以跟过往不同的软Q画风呈现人物，喜剧效果演出也大幅增加，并跟随游戏设定，以有限范围内的日常生活剧情代替持续旅行为主轴。在动画启播20周年的契机下，电视动画和剧场版动画的故事不再有关连和制作计划正式分离。
第七部 新无印/旅途篇
本作在播放前，官方率先预告内容不会单纯对照游戏《宝可梦 剑／盾》，而是会整合系列至今为止所有地区和宝可梦，制作全新的世界旅行故事，并确认不会加入副题。此外，本作亦直接采用了剧场版第20作重新设计的标志。
这部动画评价两极，加入被网友戏称“一球超人”的小豪做为主角之一，对大部分宝可梦几乎都是一球收服，既不重视培育、视宝可梦如大量收集之玩物，也去掉过去宝可梦与人的羁绊。引起极大的争议，且将过往传说宝可梦如水君，不仅被一球收服、且被过场的猎人虐待，更造成大量观众不满。
但是由于小智这部没有弱化、热爱对战、展现出优秀的冠军、好前辈等形象，而且掌握Mega进化、Z招式、极巨化三大对战系统，本部小智的目标挑战世界锦标赛，最终打赢丹帝成为世界最强训练家。
19岁的主人公佐桥皆人考了两次大学都没考上。他没有好朋友，更没有女友。突然在他面前出现了巫女装束的巨乳美少女。这个名叫“结”的少女后来因为饥饿昏倒后，皆人给了她一些吃的。少女对他产生了好感，透过接吻等的黏膜接触，使他成为自己的伙伴(称为“苇牙”)。原来少女是“鹡鸰计划”的参加者，这个计划是要让108位鹡鸰互相残杀，直到剩下最后一个鹡鸰，这个鹡鸰可以和她的伙伴一起支配世界的命运。
用语
鹡鸰计划
2020年M.B.I社长御中广人所发动的计划，让108只鹡鸰在新东京都展开死斗。为了作为鹡鸰们的战场，新东帝都被封锁，只有普通人能自由进出。
鹡鸰
鹡鸰计划的中心。共有108羽，其中1羽是成体、8羽是幼儿、99羽是胚胎、一共108羽鹡鸰。为了给苇牙引导到嵩天而被放出。外观是人，有共通的鹡鸰纹，每一只都有不同的战斗能力。大部分是女性，也存在男性的鹡鸰。对苇牙的出现会有反应，必须靠接吻等的黏膜接触使之羽化。以及鹡鸰心思及灵魂都会显示在能力上面，愤怒、憎恨、喜悦、悲伤及恋爱情感等等，当这些感情改变的幅度越大，能力受到的影响也会越显著。
鹡鸰调整
鹡鸰调整必须在幼时进行，成年之后就不需要。
祈祷语
鹡鸰加强自身力量或是使另一个鹡鸰停止机能所使用的咒语。若是要增强力量需要和苇牙进行黏膜接触;停止鹡鸰机能则需要触碰对方的鹡鸰纹。每个鹡鸰都有自己专属的祈祷语。
苇牙
鹡鸰的生存意义，苇牙能够帮助鹡鸰使用祈祷语。而如果苇牙死了的话，苇牙所羽化的鹡鸰会全部机能停止，但苇牙死亡鹡鸰就会机能停止的这一件事是M.B.I的秘密，所以只有少数苇牙知道，皆人是在和夏朗见面时夏朗觉得好玩而说出来的。
故事背景为虚构的19世纪末，梵蒂冈为阻止约7000年前发生的“诺亚大洪水”又称“黑暗三日”再度降临，创建“黑教团”，结集散布各地的圣洁，而及寻找其使用的适合者－驱魔师对抗恶魔制造者千年伯爵。
恶魔是以“机械”、“灵魂”以及“悲剧”为材料所制造出来的恶性武器。千年伯爵制造出这些悲哀的恶魔准备将世界带向终点，而被神选中的圣职者以“对恶魔武器”救赎灵魂，主角－亚连?沃克与众驱魔师将挺身而战。
漫画
作者：星野桂
出版社：日本 集英社
中国台湾地区 东立出版社
中国香港 文化传信
新加坡 创艺出版社
连载杂志：周刊少年Jump→Jump Square→Jump SQ.CROWN→JUMP SQ.RISE
连载期间：2004年－连载中
册数：刊载27卷（2020年8月4日现在）
话数：242话（2021年10月现在）
其他：由于作者个人因素，将不定期连载。
电视动画
原作：星野桂
导演：锅岛修
剧本统筹：吉田玲子
人物设定：守冈英行
音乐：和田薰
动画制作：TMS娱乐
制作：东京电视台、电通、TMS娱乐
播放电视台：日本 东京电视网
其他电视台：
播放期间：2006年10月3日－2008年9月30日
话数：全103话
用语解释
黑教团
为阻止千年伯爵把世界导向终结，所创立的直属梵谛冈抗衡“恶魔”的秘密组织。其象征以“蔷薇十字架”作标志。当中黑教团还分为七个班，分别是科学班、探索班、医疗班、通信班、警备班、对外调整和综合管理班，而驱魔师、室长和各班的职员等均以教团作根据地，因而又被喻为“家”。黑教团除本部外，还有六个分部，分别是亚洲分部、中东分部、非洲分部、北美分部、南美分部、大洋洲分部。
本部
旧本部建立于英国某处的悬崖之上，新本部则是在伦敦郊区。
室长
正名是“黑教团本部长代行监理官兼中央统合参谋司令室室长”。由考穆伊?李担任，头脑型的官职。可以向驱魔师发出任务指令，根据Lv4袭击总部时，显示其重要性好像也比得上驱魔师。科穆伊·李为了其妹利娜莉?李而进入教团成为室长。
科学班
黑教团的第一班，组员都是知识分子，主要进行对驱魔师的对恶魔武器的研究和开发，以及制造对探索部队的工作必要的武器和工具，
组员在各自的专业突出，有些擅长地质学和植物学。例如科学班瑞巴班长的专业领域是化学、数学、语言学。
另外也负责制作团服，在闲暇时还会创造很多奇怪的工具和药品，导致在搬迁新本部时造成很大的问题。
在诺亚之一的露露?贝尔袭击总部后，科学班失去了一半的团队成员，包括托普。因此，从分部补充了不少组员。
探索班
黑教团的第二班，班组成员称为探索部队（Finder），隶属于黑教团及世界各地的支部。
非驱魔师的普通人类，圣洁的落空者。负责收集全世界的情报来支援驱魔师，根据其怪事件来寻找圣洁。
由于容易撞见同样在搜索INNOENCE的恶魔，因此是死亡率最高的职业。
武器是结界装置，在驱魔师未到达现场前，用其抑制恶魔的活动（但结界装置本身并不具备摧毁恶魔的能力）。
医疗班
黑教团的第三班，负责替团员治疗，除了伤患之外，还治疗病人，以护士长、医生为中心。
通讯班
黑教团的第四班，负责协助驱魔师、探索部队的通讯工作。
警备班
黑教团的第五班，主要在大门和水路出入口进行警戒工作，门卫アレスティーナ＝ドロエ＝ギョナサン＝P＝ルーボーソン＝ギア＝アマデウス＝5世就是其中之一。
对外调整班
黑教团的第六班，对外视窗，负责受理各国的支援请求。
综合管理班
黑教团的第七班，从炊事、扫除、到支付经费，为团员的日常生活提供帮助，厨师长─杰利就是其中之一。
元帅（General）
在职位上比一般驱魔师高一级的驱魔师，而且都是与圣洁同步率超越100%以上的“临界者”。而“临界者”也是成为元帅的最基本条件。通常元帅要定期与教团联络。元帅的主要工作是四处寻找“适合者”来成为“适合者不明的圣洁”的“适合者”，成为“驱魔师”。另外元帅还会参与训练新的“驱魔师”，例如克劳斯?马里安是亚连的师父、弗罗?提艾多尔是神田的师父。元帅还会参与其他教团的任务。
教团原本有五位元帅，分别是凯文?伊尔卡、克劳斯?马里安、弗罗?提艾多尔、维达兹?索卡罗、可劳德?纳因。由于其中最年长的元帅——凯文?伊尔卡元帅被诺亚中代表着“快乐”的緹奇?米克所杀，而克劳斯?马里安元帅在告知亚连是继承了“第14任”的“奏者资格”一事后，与寄生型圣洁“圣母之柩”一起下落不明，留下“断罪者”和大量血迹。目前尚有三位元帅于教团中。在漫画217话中神田接替克劳斯?马里安元帅的位置，成为新元帅。
大元帅
“黑教团”的最高上级，可以对元帅及室长下达命令。身份不明，是不是适合者也不明。与元帅一样同样有5位。
驱魔师
每一个圣洁都会选择一个人作为其使徒，亦即是“适合者”，而驱魔师就是加入了“黑教团”的圣洁适合者。属于“黑教团”的前线人员，专门负责回收沈睡在世界各地的圣洁和破坏“恶魔”的圣职者。全体“驱魔师”都穿着黑色的团服。团服的胸口位置有作为“驱魔师”象征的“蔷薇十字架”标志。通常“适合者”是由“元帅”发现，并带到“黑教团”成为驱魔师（这些“适合者”可能在被“元帅”发现前已经拥有圣洁，例如亚连。或是与“元帅”带出去的“适合者不明的圣洁”同步，才发现是“适合者”，例如迪夏·巴里、赵志?韩。）教团为确保作战能力和保护“心”等的情况，也有“适合者”是被“黑教团”发现，强制地被带去成为驱魔师（例如利娜莉?李、斯曼·达克）。
驱魔师的装备
团服
团服是“驱魔师”的证明，是驱魔师值勤时及战斗用的服装，在左胸的位置会有黑教团“白蔷薇十字”纹章，团服上的装饰全是银制品（元帅级驱魔师的团服装饰则是金色），团服的扣子背面则会刻上所属驱魔师的名字。
因为一般而言难以辨别普通人及伪装的恶魔（亚连·沃克算是极少数的例外），所以团服本身也有着吸引恶魔主动现身攻击，借此找出恶魔的作用。
一般以大衣款式居多，但也有诸如斗篷或外套等其他形式，在形式上相当自由。
而在故事中，总共出现过三种版本的团服。第一代团服以黑白双色为主，有大片的白色垫肩；第二代相较于第一代，配色上减少了白色的比例，并将半数的扣子改成拉链设计；第三代团服不同以往，配色改成黑色为底红色为衬，设计上也比前两代要简洁。
无线通讯魔偶（Golem）
由黑教团科学般制作，让驱魔师之间能够进行短距离无线通讯的机器人，外观上通常是黑色并有一对翅膀的眼睛状物体，能够飘在半空中。
除了短程无线通讯以外，似乎也能介入一般民用的电话网络来和远方的驱魔师或是黑教团本部进行联系。
驱魔师的人数
亚连正式加入教团时，包括他在内共有十九名驱魔师，分别是五位元帅（凯文?伊尔卡、克劳斯?马里安、弗罗?提艾多尔、维达兹?索卡罗、可劳德?纳因）和十四位驱魔师（亚连?沃克、神田优、利娜莉?李、拉比、书人、诺伊斯·马利、迪夏·巴里、斯曼·达克、卡沙·李德、查克·拉朋、缇娜·斯帕克、格温·弗雷尔、索尔·加伦、黑布拉斯卡）。
方舟大战后，驱魔师的人数下降至大约十四名，分别是四位元帅（克劳斯?马里安、弗罗?提艾多尔、维达兹?索卡罗、可劳德?纳因）和十位驱魔师（亚连?沃克、神田优、利娜莉?李、拉比、书人、诺伊斯·马利、米兰达?罗德、亚历斯特?柯洛利三世、赵志?韩、黑布拉斯卡）。
而截至目前为止，驱魔师人数剩下十三位，分别是是四位元帅（神田优、弗罗?提艾多尔、维达兹?索卡罗、可劳德?纳因）和九位驱魔师（利娜莉?李、拉比、书人、诺伊斯·马利、米兰达?罗德、亚历斯特?柯洛利三世、赵志?韩、提摩西·哈斯特、黑布拉斯卡）。
第二驱魔师
在九年前“黑教团”的第二使徒计划（制造驱魔师的实验）中所创造出的驱魔师。利用垂死的驱魔师的脑袋制造出克隆人后，再令他们与原拥有的圣洁同步。第二驱魔师有着超速的再生能力。在此计划中成功制造了两名第二驱魔师，分别是神田优和阿尔玛，他们的血液也有治疗其他人的作用。
第三驱魔师
通过第三使徒计划中，所创造出的驱魔师。破坏“恶魔”的方法，暂时只有三个，分别是“恶魔”自爆，被圣洁消灭和“恶魔”吞食同类（较强的“恶魔”当没有人类可杀戮时，会吞食其他较弱“恶魔”，“恶魔”吸收“恶魔”）。而第三驱魔师就是利用“恶魔”吞食同类这一点。利用“卵”的碎片与人类融合的阿尔玛·卡尔玛细胞移植到一般人的体内，进行将人体半恶魔化的实验，制造出人体生成的半恶魔化人类。利用半恶魔化人类来吞食“恶魔”，吸收一定数目恶魔后，就会母胎化。母胎化的的第三驱魔师将被奉献于神明，而他们的细胞则能用于生出更多的第三驱魔师。第三驱魔师也有再生能力但不及第二驱魔师。第一代的第三驱魔师有5名，分别是多克萨、基蕾德莉、刚志、蒂瓦葛、玛达拉欧。
圣洁
「圣洁」被称为“神的结晶”，是有着不可思议力量的物质，是人类抗衡及对付千年伯爵所制造的“恶魔”和“诺亚一族”的武器。总数是109个，7000年前随着大洪水爆发而散落到世界各地，通常有圣洁的地方都会因此发生某些以一般常理无法解释的怪异现象。其中有一个称之为“心”的核心，一旦“心”被毁灭所有圣洁亦同时消失。圣洁“原石”的形态是一个正立方体结晶，周围会有两个交叉的齿轮圈。当该圣洁的适合者成为驱魔师，该圣洁便会成为对恶魔武器。对恶魔武器可分为“寄生型”、“装备型”、“结晶型”与“独立型”。
种类
装备型
由于圣洁原石的力量过于强大，所以即使是适合者本身也难以完全控制。因此必须透过科学班将圣洁武器化后才能交由适合者使用。这些武器化后的圣洁就被称为装备型。
例子：拉比的槌子、书人的天针、克劳斯?马里安的断罪者及其它等等。
结晶型
装备型的进化。是跟适合者的血液交换，然后圣洁从适合者使用武器的部位随同血液流出并重新构成武器。由于血成为了驱魔师和圣洁之间的媒介，因此能够获得比装备型更强的力量。甚至在损坏时，也可能只需要适合者的血液便可以修复。目前的结晶型继利娜莉?李的圣洁之后，神田于阿尔玛的事件之后圣洁也成为了结晶型。
寄生型
寄生型是人体和圣洁在细胞层上结合，将肉体改变为“对恶魔武器”，平时不发动的话会保持在人体状态。和装备型不同，寄生型可说是用人体来作为抑制圣洁的存在，因此寄生型的威力较强，不过由于圣洁的力量过于强大，寄生型驱魔师的寿命一般较短，同时万一圣洁遭到破坏，将连同武器化的身体部位一同失去。
因为和圣洁融合的缘故，寄生型适合者可使用圣洁净化入侵体内的恶魔毒素。
目前寄生型驱魔师包括亚连（左手），亚历斯特?柯洛利三世（牙齿）及提摩西（凭神）
独立型
不需要适合者就可自行发动的圣洁。平时伪装成人类，解除后全身白色皮肤、胸口有圣洁标记、眼瞳与眼白的颜色是绿色和红色。
独立型完全是为了守护“心”而存在，知道心的真正位置所在，千年伯爵称之为“被隐藏之物（Apocryphos）”。
目前的独立型圣洁伪装成枢机主教。
降咎
圣洁若与其适合者的圣洁同步率为0%，或者非适合者强行与圣洁同步，会造成失控的现象，并且吞噬其同步对象形成“降咎”。所谓的“咎”是降给非使徒（圣洁的适合者）之罪，与圣洁的同步率在零以下仍要与神同步，此为罪人故形成降咎。这时候由于圣洁的力量完全失控，并以摧毁同步对象而获取能量，其破坏力会变得极为强大，并且敌我不分地破坏身边所有东西，造成“降咎”的同步对象会在24小时以内死亡。
一般来说，适合者的圣洁同步率不可能会低于0%或以下。造成这个情况可能是适合者背叛了神，例如驱魔师斯曼·达克向千年伯爵、恶魔或诺亚一族屈服，把“黑教团”的情报透露给他们；或者是黑教团的人造使徒计划（第二使徒实验），在圣洁非适合者（如死亡的适合者其亲属）的身上试图强加圣洁，都会造成降咎。
临界者
所谓临界者为圣洁与其适合者同步率高于100%临界点的适合者，同时也是元帅级驱魔师资格的最低限度门槛。亚连在方舟之战中亦超越100%同步率，成为临界者。
中央厅
鸦
隶属中央厅的秘密组织，已知战斗能力很高。目前知道“鸦”多数用符咒等的能力来进行战斗。已知“鸦”的成员有：多克萨、基蕾德莉、刚志、蒂瓦葛、玛达拉欧、林克
人造使徒计划
非适合者的人体实验
是制造驱魔师的实验，在第二使徒计划同期或更早期已经开始。在非适合者（不是该圣洁的适合者）的身上强行加入圣洁，或要使非适合者与该圣洁强行同步，尝试从中制造出驱魔师。根据利娜莉?李的叙述，她曾经看见一个普通的孩子，被强制把把圣洁放进他体内，最后同步失败变成降咎。后来经过的补充知道这个也是属于人造使徒计划。因为利娜莉?李8岁的时候已经遇到神田，而看见这个实验计划的时候是9岁，因此推算这个实验计划在第二驱魔师计划的悲剧后仍然进行。这个实验计划是由黑布拉斯卡把圣洁放进普通人类的体内（例如普通或是已死的适合者的亲属）强迫与圣洁同步。现在因为人造使徒计划失败（实验体最后都变成降咎），已经停止计划。
第二驱魔师的计划
在九年前开始的人造使徒计划，在无法取得任何成果的非适合者的人体实验过后，教团决定着手把适合者人造化，来维持驱魔师的数量。“第二驱魔师计划”就是通过把失去战斗能力的驱魔师的大脑移植到别的容器里，尝试把圣洁的适合权转移的不人道实验。计划中的实验体，阿尔玛和神田优就是从这个实验中所诞生的人造适合者。可是最终这个实验计划最后却酿成悲剧，因为其中一名实验体阿尔玛的暴走，使得46名研究人员死亡。
第三驱魔师的计划
利用第二驱魔师的计划中的实验体阿尔玛与“恶魔卵核”融合，从而制造出阿尔玛·卡尔玛这个第一母胎。由于一般人的肉体不能承受“恶魔卵核”的能量，会导致细胞坏死，所以选择有再生能力的第二驱魔师来与“恶魔卵核”融合。把阿尔玛·卡尔玛的细胞复制，并移植到其他人的身上，使他们成为第三驱魔师。第三驱魔师有着要母胎化的使命，当他们体内的阿尔玛·卡尔玛细胞通过吸收恶魔而增幅后，就会母胎化。母胎化的的第三驱魔师将被奉献于神明，而他们的细胞则能用于生出更多的第三驱魔师，不断重复过程，使对恶魔的战力能扩大，成为拯救世界的基础。
恶魔（AKUMA）
亚连?沃克曾说过“并非一般概念中的恶魔，而是用这个名词称呼的武器，是为了对付人类制造的武器”。如上所述，恶魔是以“机械”、“灵魂”以及“悲剧”为材料所制造出来的恶性武器。当人们碰到“悲剧”（确切说来，特别指失去重要的人）之时，千年伯爵便会出现，并询问失去重要的人之人是否要让失去的人复活。若此人向千年伯爵的特殊机械呼喊失去之人的姓名，其人的灵魂便会变成恶魔，之后恶魔就会遵从伯爵的命令去杀死那个人，并侵入其体内，伪装为人类的外表，继续杀害其他人类。 目前破坏恶魔的方法有三种：圣洁破坏恶魔、恶魔的自爆、恶魔吞食恶魔。不过只有被圣洁破坏的恶魔灵魂才能得到拯救，自爆及被吸收的恶魔灵魂只能悲哀的随着被破坏而消失。
恶魔之血
恶魔的血液，对人类而言是剧毒的液体，被恶魔之血入侵的人类身体会在很快的时间内被侵蚀，并且灰飞烟灭。寄生型的驱魔师对恶魔之血是有免疫的，例如：亚连、亚历斯特?柯洛利三世及斯曼·达克，装备型的神田则是特别例子（和他胸口上的梵印有关）。此外，由中国前往江户途中，拉比被恶魔击中过，在恶魔之血发作前被柯洛利吸出来而存活。
恶魔的进化
恶魔通过杀戮一定数量的人类得到进化。目前漫画中已出现过LV2、LV3、LV4及多头合体的恶魔。高等级的恶魔拥有更强的能力，在没有人类可杀戮时，弱肉强食其他低级数的恶魔。
守化髅
原身为拥有头脑聪敏的人类，在教团总部被入侵时，科学班的科学家就被改造成守化髅，其中还包括亚连的好友塔普。被魔术改造了身体寿命约200年，身体非常坚固，能抵御普通刀枪。负责的工作有制造恶魔﹑打扫方舟﹑帮伯爵缝衣服及一般杂务。
千年伯爵
恶魔的制造者。以“机械”、“灵魂”、“悲剧”制造出恶魔，和恶魔还有诺亚一族一起将世界导向终结。
仲介人
提供“情报”和提供当作恶魔“材料”的人类，换取金钱为此与千年伯爵交易换取利益。
诺亚一族
据书人及拉比说历史称他们为“无痕一族”，自称是7000年前上帝用洪水（“诺亚大洪水”）毁灭人类时被选中的使徒诺亚的后代，人类最古的使徒，是真正被“神”所选中的人，声称驱魔师才是被虚伪的神所选中。拥有深不可测的强大能力，能够自愈重生和破坏圣洁，但圣洁仍然是他们的弱点。身体流有诺亚的遗传因子，拥有作为白色（人类）姿态。以及黑色（诺亚）的姿态，身体的特征是，额头有十字圣痕，皮肤靠近灰色和褐色。
诺亚一族的人数
共有十三名使徒和原本不应存在的“第14任”，是7000年前使徒诺亚的后代，值得一提7000年前的诺亚并不是一个人来的，而是十三名使徒一起出现的。由于诺亚大洪水后，除了被“心”打败的第一使徒千年伯爵外，其余的十二名诺亚作为了第二亚当，成为了现代人类的祖先。所以往后现代人类都是拥有诺亚的遗传因数，为了保护第一使徒千年伯爵，每个时代里都会有十三个人由于诺亚的遗传因数觉醒并诺亚化。
第一使徒?千年伯爵
第二使徒?裁(トライド)
第三使徒?快乐(ジョイド)
第四使徒?欲(デザイア)
第五使徒?智(ワイズリィー)
第六使徒?蚀(フィードラ)
第七使徒?恤(マーシーマ)
第八使徒?怒(ラースラ)
第九使徒?梦(ロード)
第十、十一使徒?绊(ボンドム)
第十二使徒?色(ラストル)
第十三使徒?能(マイトラ)
第十四号(前代诺亚使徒基于嘲讽而取的绰号，并不将他视为第十四使徒)
诺亚记忆
为了保护第一使徒千年伯爵，7000年前第二至第十三名使徒的记忆会转生到十二名诺亚化的人类。十二名诺亚化的人类都各自遗传了7000年前第二至第十三名使徒的记忆，称为“诺亚记忆”，记忆中包括7000年前自己的名字。即使遗传了“诺亚记忆”但十二名诺亚化的人类会无意识地抑压着记忆，因为自我意识会拒绝被“诺亚记忆”吞噬掉，所以他们不算完全觉醒。只有持续生存了7000年的第一使徒千年伯爵和当中遗传了7000年前第五使徒“智”记忆的人（这是因为第五使徒有能偷窥脑的魔眼）除外。
诺亚方舟
虽说明为方舟，但外形是由多个立方体组成，完全没有船的外形。内部是类似南欧风格的城市，城市内有林林总总的房子。“奏者”可透过诺亚方舟在自己去过的地方展开传送门，传送门是与诺亚方舟的房子的门是互相连接着的，人们可以透过进入传送门瞬间转移到诺亚方舟的内部，再经其他房子的门到其所连接着的传送门，到该传送门展开的地方，而且方舟还拥有好几个被称为“房间”的空间——恶魔制造工场、“第14任”的秘密房间（谜之钢琴房）等。
方舟暂时共有两艘，分别是亚连操纵的旧方舟和千年伯爵开拓的新方舟。
旧方舟
7000年前大洪水中的诺亚一族所使用过的船。后来受“第14任”的诅咒，弄得方舟出了好多毛病，“第14任”更把“奏者”的资格交给别人，使旧方舟的主体从此停留在日本江户不能脱离，只有继承“第14任”的“奏者资格”的人才能解除江户连结，但传送门的功能仍然能使用。
由继承“第14任”奏者资格的亚连重新启动，解除江户连结后目前主体在旧本部上空。旧方舟由于受“第14任”的诅咒一直不能离开江户，所以被千年伯爵所放弃，在把旧方舟下载到新方舟时，亚连等人（神田、拉比、柯洛利和赵志）跟随被千年伯爵拉到旧方舟的莉娜丽，进入到旧方舟内部。在下载期间，每下载完一个地方到新方舟，该地方便会崩毁，吸进次元隙缝，然后毁灭。千年伯爵本想把莉娜丽拉到旧方舟，与旧方舟一起吸进次元隙缝，然后毁灭，但却意外把亚连等人都拉到旧方舟。最后旧方舟下载到最后一个房间恶魔制造工场（存放“恶魔之卵”的地方）时，被拥有“奏者资格”的亚连，找到了“第14任”的秘密房间并成功终止下载和毁灭程式，把先前被摧毁的地方复原。旧方舟现由拥有“奏者资格”的亚连操作，但控制权则是“黑教团”的高层。
新方舟
旧方舟由于受“第14任”的诅咒不能离开江户，所以千年伯爵制造新方舟来取代旧方舟。新方舟由千年伯爵掌管。这方舟都拥有一个和旧方舟的“谜之钢琴房”相似的“房间”。
奏者
对诺亚方舟有着重大影响的人。昔日的奏者第14任背叛了千年伯爵，将奏者的资格交给其他人，而遭到杀害。因此，旧有的诺亚方舟失去了奏者而无法启动，一度逗留在日本的江户，后来由拥有“奏者资格”的亚连和蒂姆恰比重新启动。* 现存的奏者只有千年伯爵、长子罗德?贾梅托以及亚连?沃克。所以，制造新的诺亚方舟的时候，由罗德重新下载旧有的诺亚方舟程式。