面具的人物角色
蝶野攻爵（蝴蝶假面男）
声：真殿光昭；台：李景唐（Animax版）／于正昌（DVD版）
本作的第一配角，虽然外型和作为相当奇异，但那独特的人生观使得他有不少的支持读者。以前是同校高中三年级，身体很差（要吃的药有十多种）但却是个百年难得一见的天才。虽然是人造生命体，但是与主角有着亦敌亦友的微妙关系，只承认勝紀一人可以叫他人类时名字，非常看重勝紀，甚至在心中没有任何人可取代勝紀的地位，最后还为勝紀制造第二颗可以抵消黑核铁能量的白核铁，帮助他恢复人类状态。在与勝紀的决斗过后，以“蝴蝶面具”的身份重新展开自己的生活，并且在新闻上成为都会传说。在动画版的造型变化，最后将桃红色换成橙色。
武器：黑色火药：垂死快乐（NEAR DEATH HAPPINESS）－核铁61号
左右田 右卫门左卫门（そうだ えもんざえもん）声：小山力也
年龄：不详、职业：内部监察官、所属：尾张幕府、身份：总监督补佐、所有刀：炎刀‘铳’、身长：6尺1寸、体重：15贯、兴趣：扫除（天花板上）。
否定姬的心腹，尾张幕府家鸣将军家直辖内部监察所总监督辅佐，原忍者，是相生忍军的最后一人。自号“不忍”。
穿着黑色的洋服，脸上戴着写“不忍”二字的面具，腰间别着大小各一的武士刀。跟真庭凤凰曾经是挚友，但是在被凤凰使用命结夺走脸之后，自称“精神已经死过一次”。从此跟随否定姬，并且以此为人生的全部。
身为相生忍军末裔，使用“相生拳法?背弄拳”来使自己永远位于战斗的上风位置。炎刀‘铳’的使用者。
最终决战时以炎刀力拼七花不敌，死于七花之手，炎刀被七花破坏。
犬坂七绪（犬坂 七緒（いぬさか ななお），声：和气杏未）
不知所属武士团的神秘少女。跟随四郎行动，称四郎为“主人”。
折纸旋风/伊凡·卡雷尼(折紙サイクロン/ イワン・カレリン，Origami Cyclone/Ivan Karelin，声：冈本信彦/港：胡家豪/台：黄天佑)
所属公司：HELPERIDESE FINACE
第一季剧场版1剧场版2第二季
.ANIME、高须整形美容诊所(第14话之后加入)、NAMCO応援団(第14话之后加入).anime、miniminiNAMCO応援団、DMM.com、大江戸温泉物语南梦宫、唐吉诃德、伊藤园等
英雄训练学院的毕业生，内向、安静，喜欢日本忍者文化。
穿著像是忍者一般的英雄，擅长出现在摄影画面的一角抢镜头。
予人感觉好像只是个为了打广告而做英雄的英雄，其实是自卑影响表现，不过在与虎彻合作后开始变得积极。
NEXT能力为“变形/易容”
弗莱迪·曼迪（フライデー·マンデー，配音员：江原正士）
安纺的真面目。几年前打开真实之门，引起内乱的幕后黑手。动画第19集时，被卡洛沙·多尔开了一枪，但似乎没有死。多次被击中都没死。最终在最后一集被玛德拉丝击毙。
菊千代（キクチョ）
配音：（日）コング桑田、（港）李锦纶
武器：巨型长刀，可以以振动方式化成巨锯。
简介：出身于农民阶级，自觉农民与武士的待遇差别后，决定将自己从户籍纪录中删去并成为武士，又将自己身体改造成力量型的生物机械。个性自大、口不择言、鲁莽冲动，却很富同情心，受小孩子欢迎。被发现他在族谱中所记的参战年龄为十三岁。神无村军旗中的三角形正正代表他特别的背景。在战争中为保护神无村而死去。
劳·卢·克鲁泽(ラウ・ル・クルーゼ，Rau Le Crueset)
配音：关俊彦(日本);陈欣→雷霆(中国香港);熊肇川→于正昇(中国台湾)
生日：C.E.43年6月12日
星座：双子座
年龄：28岁(KIA)
身高：183公分
体重：77公斤
血型：O
种族：自然人/克隆人
介绍：
为第一季的最终反派，亦为第二季命运计划的背后影响者。自由条约黄道联盟高阶将领，戴着一副白色面具，为人神秘，最终决战时操作“ZGMF-X13A 神意高达”。
扎夫特精英部队克鲁泽小队的指挥官，为了隐藏素颜，平常总是戴着面具示人，因而被称呼为“假面之男”。
故事开端即率领小队成员阿斯兰·萨拉等人于中立国欧普的资源卫星殖民地“赫立奥波利斯”发动攻击，最后成功强夺大西洋联邦开发的G兵器五机中的四机，此后执拗地追击突击高达与新造舰大天使号。
其假面下的真面目为穆·拉·福拉卡之父——亚尔·达·福拉卡的克隆人，此事须追溯至C.E.46年，悠连·响博士研究人工子宫不顺利，研究资金困难;亚尔便找上响博士表达愿提供援助，交换条件是响博士必须为他制作自己的克隆人。由于亚尔认为独生子的穆不足以成为福拉卡家族的继承人，故希望能复制出最优秀的自己，完成长生不死的梦。尽管复制、创造人类的行为是违法的，响博士最初面露难色，但在亚尔的威胁利诱以及对超级调整者的渴望下，结果仍接受其条件。然而，由于复制技术的不成熟，响博士仍无法解决技术上染色体端粒基因缩短的问题，身体会迅速老化是体细胞复制的宿命。克隆人年纪轻轻就得面对提早死亡的恐惧以及自己这张布满皱纹的老脸，只能长期服用抗老化药物来延缓，没有梦想也没有未来。因此劳认为自己有制裁全人类的权力，即白老鼠的复仇。劳作为“失败品”被带回福拉卡家，与穆成为兄弟面对面生活一段时间，期间名字不详。然而，亚尔对于这个“失败品”十分失望，劳亦憎恨亚尔抛弃了自己这个诞生于不幸的身体，无法抑制自己的憎恶之心，于后年纵火烧毁福拉卡邸，导致福拉卡夫妇两人死亡。之后劳便改以劳·卢·克鲁泽之名活着并前往P.L.A.N.T.。
虽然有缺陷，克鲁泽仍继承福拉卡家族遗传的才能，拥有异于常人的直觉和强大的空间认识能力，较穆更接近亚尔。除了天分，或许还有复仇的执念，克鲁泽以优秀的驾驶员资质存活下来。C.E.68年，适逢P.L.A.N.T.在扎夫特建军时入伍，于驾驶员养成课程中以优秀成绩毕业并获得了菁英证明的赤服(扎夫特红衣)，克鲁泽很快地就在C.E.70年爆发的血腥情人节战争中出阵，且作为毫不逊于调整者的王牌驾驶员崭露头角，活跃在前线中。与此同时，他遇见了后来就任P.L.A.N.T.最高评议会议长的基因工程学者吉尔伯特·杜兰朵，不久两人便成为好友，克鲁泽从其口中得知自己身为克隆人的残酷真相，杜兰朵则供应克鲁泽其特制的抗老化药物。不过，两人之所以关系密切，似乎是因为克鲁泽是唯一愿意倾听杜兰朵发表高论的人;尽管两人理念完全相反，仍时常针对“世界”、“人类”等主题进行对话。同时期，克鲁泽将与自己同样作为亚尔·达·福拉卡克隆人的雷·札·巴雷尔接回来保护着。另外，往后的时间点，克鲁泽发现可谓是超级调整者基拉·大和的原型卡纳得·帕尔斯，增加他对基拉的敌意。
C.E.70年2月22日的世界树攻防战，以MS击破MA37机、战舰6艘，如此惊人的战绩被授与相称的星云勋章。另外，此时期的克鲁泽因为染色体端粒基因过短之故，开始将素颜隐藏在假面里掩盖自己的老去。接着同年6月2日，搭乘ZGMF-1017M 基恩高机动型(Ginn Type High-Maneuver)的量产型一号机于格里马尔迪战线摧毁地球联合军第三舰队，作为顶尖之枪(Top Gun)勇往直前的活跃被扎夫特领导层注意到。在月面的安提米翁这场战斗中，克鲁泽与穆·拉·福拉卡所属的TS-MA2mod.00 梅比乌斯零式(Möbius Zero)部队交战，尽管克鲁泽大破当时处于技术劣势的地球军，然而其中一架零式的驾驶员仍能与克鲁泽打至不相上下，那个驾驶员就是穆，那时的克鲁泽也是第一次与穆进行感应并进行潜意识对话，然而穆早已忘记克鲁泽的存在。随后克鲁泽由于战功显赫当上了白衣指挥官，并拥有了自己的克鲁泽队，指挥纳斯卡级战舰威萨留斯号。而零式小队唯一生还的穆被地球联合军表扬，并冠以“安提米翁之鹰”的外号。此后双方的因缘存在很长一段时间。这份令人惊异的优秀，周围的扎夫特兵士对他的实力和功绩抱持强烈嫉妒的人也不少，但没有人注意到他其实是自然人;此事仅有杜兰朵与雷知晓。
C.E.71年，为了向创造自己而导致自身悲剧的人类和世界报复，克鲁泽利用地球联合对P.L.A.N.T.的战争，追求着升级为全面战争乃至于双方共倒，期望全人类相互屠杀至灭绝为止。为此克鲁泽多次努力计划，保持战局的均衡，以免形成对单方面有利。1月25日，克鲁泽莫视领导层的指令私自率领克鲁泽小队侵略中立的卫星“赫立奥波利斯”，夺取地球联合军最新型机动兵器“G兵器”五机中的四机;为扎夫特取得PS装甲与光束兵器小型化的技术，并在战后以此告戒扎夫特的高层，让他们开始意识地球军新技术对战况的威胁，加剧了双方的矛盾，而“赫立奥波利斯”亦在此战被彻底摧毁。
及后克鲁泽和他的克鲁泽队持续追击大天使号，并在追击中攻陷了阿尔缇蜜斯要塞和消灭了地球联合军第八舰队，使大天使号紧急迫降在地球上。
克鲁泽为了使战况更为平衡，决定将“Operation Spitbreak”作战的目标地点是地球联合军统合最高司令部的约书亚(JOSH-A)基地一事泄漏给身为敌方的联合军，招致5月8日联合军得知事件后，故意让扎夫军攻入并启动“独眼巨人系统”自爆，让扎夫特在地球的部队在阿拉斯加几近全数毁灭的事态。接着又秘密地入手扎夫特最新锐MS——正义高达(Justice Gundam)与自由高达(Freedom Gundam)搭载的中子干扰消除器的资料，再透过俘虏芙蕾·阿尔斯達之手将此机密送给蓝色宇宙盟主穆尔塔·阿兹拉埃尔，让地球联合军重拾核攻击能力，并在接下来9月23日的波亚兹攻略战，联合军得以用核弹迅速攻陷P.L.A.N.T.的宇宙要塞波亚兹，引发P.L.A.N.T.全体的愤慨。接着联合军于9月26至27日的第二次雅金·杜威攻防战再次对P.L.A.N.T.本国发射核弹，如此一来便轻易地引导阿斯兰·萨拉之父帕特里克·萨拉为报复而下令向联合军与地球发射伽玛线激光兵器“创世纪”，每一步都是为了报复人类陷入更恐怖的相互憎恨与屠杀的漩涡中。
在第二次雅金·杜威攻防战的后期，克鲁泽亲自驾驶同样搭载中子干扰消除器的神意高达(Providence Gundam)出击，首次于实战操作“龙骑兵系统”即展现压倒的战斗能力击坠联合军绝大多数敌机，并大破穆的突击高达和迪安卡·艾斯曼的暴风高达。在与基拉·大和的自由高达势均力敌的对决中，击毁芙蕾的救生舱，芙蕾之死令基拉陷入悔恨和痛苦之中，使其发动SEED能力。最终再次与基拉死斗，尽管最后神意高达在远程中重创了自由高达，但座机神意高达的驾驶舱仍在近战中被自由高达的光束军刀刺穿，随后卷入创世纪爆炸的风暴中被消灭，克鲁泽战死。
战后，基于尤尼乌斯条约的安排，地球联合与P.L.A.N.T.两阵营召开国际法庭审判每个战犯。此时克鲁泽在仍是嫌疑人死亡的状况下被认定为P.L.A.N.T.侧的战争罪人，具体罪状尚未明了。
在SEED爱好者中，拥有不同于一般反派脚色，憎恨世界的思想与逻辑非常鲜明的克鲁泽是一个广受支持者爱戴的角色。克鲁泽在许多场景的台词都深刻的点出了身为一个克隆人的孤悲：且被制造者唾弃、受诅咒般的短暂的生命因而对世界憎恨，发人深省的思考面让基因克隆人的话题拥有更多的解读。然而在被基拉击破的那一瞬间，克鲁泽带着笑容而逝的画面，说明了对他来说自己的死亡才是比起毁灭世界更为完美的结局。
在《SEED DESTINY》HD重制版，雷·札·巴雷尔被泰莉亚·格拉迪斯拥抱时，追加了他看到没有携带面具的素颜克鲁泽对他温柔微笑的一幕。这或许可以解读为透过死亡而解脱的克鲁泽对于雷的努力感到欣慰，并期望他也一同获得安宁。这亦是非常稀有的，拥有克鲁泽正面素颜的画面，而克鲁泽面容比起他实际上的28岁明显老上许多。
为本作系列的第一位面具男，似乎是向初代高达系列的“红色彗星”夏亚致敬。
半藏是动漫《火影忍者》中的登场人物，前雨隐村的首领，被视为忍界的顶点，被誉为“半神”，因为体内植入了山椒鱼的毒囊，所以又叫山椒鱼之半藏。
宇智波带土是动漫《火影忍者》中的重要人物，火之国木叶村的宇智波一族成员，擅长使用时空间忍术“神威”、宇智波禁术、阴阳遁术等技能。
宇智波带土的故事可以说贯穿了整部火影的主线，早期是波风水门的弟子，在宇智波斑的算计之下开始误入歧途、坠入黑暗，以宇智波斑的名字行动，逐步策划执行了第四次忍界大战；“晓”组织的实际掌控者，因一直带着面具，被称为“面具男”。
桃儿卡卡(タオカカ，Taokaka，声：斋藤千和)
血型：O 身高：162cm 体重：42kg 生日：2月22日
战斗用种族“卡卡族”的一分子，以六英雄之一的兽兵卫基因制造而成，其长相尚未公开。
阶层都市的扩建遮蔽了卡卡族的阳光，因此她成为除罪者(咎追い)，想借由捕捉史上赏金首拉格纳以取回属于卡卡族的阳光。个性很像小孩子，会擅自帮认识的人取绰号并以该名称呼之，食量很大，使用隐藏在靴子和袖子里的钢铁巨爪战斗。
CF后日谈回到家乡与族人团聚
马格努斯/赤羽天全(マグナス / 赤羽 天全(あかばね てんぜん)，Magnus，声：小野友树)
就读华尔普吉斯皇家机巧学院“机巧技术科”。具有参加华尔普吉斯的夜会资格，为魔王的候选人之一，同时为有资格参与夜会的“手套持有者”中排位最高的“十三人”之一。
登记代码为“元帅”，夜会排名顺位为第一位，擅长同时驱动六具人偶的战队的集团战法，战力堪比数艘军舰，因此也有“一人军队”的别名。
脸上总是带着银色的面具。除了是出色的人偶使以外也是优秀的人偶匠，六具人偶全部是自己创造。在学院里创下历代以来所有科目皆是第一的成绩，因此学生们皆敬称他为“伟大之人”。
从雷真转入学院后没多久就碰见了对方，并从雷真那拿到了抚子的骨灰。总在观察著雷真的战斗，并做出了不低的评价。
真实身份是雷真的哥哥赤羽天全，是赤羽一族有史以来最出色的天才，在族内有神童、鬼神之称，甚至被认为是超过了一族的始祖的奇才。但是在某日突然杀死了除了雷真以外的其他族人，之后便消失无踪。
灭掉赤羽一族的目的是“造神”(似乎和神性机巧有关)，实际上是土门家早已决定要灭掉赤羽家而选择忍到最后拯救自己的弟妹。并很在意著雷真的红翼阵能否完成，于十六卷遭雷真击败，以自己的性命和战队的人格复活了抚子。
本人从不承认也不否认自己是天全，但是在第七卷与雷真战斗时说出了应该只有赤羽一族才知道的红翼阵的详细内容，而被雷真断定他就是赤羽天全。
对人偶的态度非常飘忽，显得漠不关心的同时又不是完全地置之不理。
第十四卷在夜夜面前承认自己确实是赤羽天全。
火垂(火垂(ほたる)，声：花泽香菜)
马格努斯的少女型人偶。魔术回路为〈压力〉，并能驱使这过程中造成的热量。
拥有恐怖的爆发力，还有惊人的耐久力。
敌视着与马格努斯为敌的雷真。感觉马格努斯只把她们当物品来看待时看到了雷真对雪月花姊妹的态度而有些动摇，因此开始思考起自己的存在对主人马格努斯究竟是什么。
会表示人偶不需要人类的感情，但很珍惜伊吕里在某天送来的怀炉。对雷真与马格努斯之间的关系很有兴趣，因而趁和雷真一起行动时询问过，不过雷真没有说出自己和马格努斯有什么关系，也没说出妹妹抚子与她容貌相同的事。
外表十分像雷真的妹妹(赤羽抚子)，也继承了极少部分来自抚子的记忆，不过不知道那些片段是什么。
玉虫(玉虫(たまむし))
马格努斯的少女型人偶。魔术回路为〈魔力吸收〉。能够夺取目标(人偶)的魔力，本来是理论上控制很困难的一种魔术。
镰切(鎌切(かまきり))
马格努斯的少女型人偶。魔术回路为〈空间转移〉，能转移到特定的场所，本来是发动就很困难的魔术。
蜻蛉(蜻蛉(かげろう))
马格努斯的少女型人偶，魔术回路不明，推测可反射冲击。
蜘蛛姫(姫蜘蛛(ひめぐも))
马格努斯的少女型人偶。魔术回路为⟨蜘蛛丝⟩，能连结战队间的意识
蜜蜂(蜜蜂(みつばち))
马格努斯的少女型人偶。魔术回路不明，可治疗人偶的伤势。
黑(黒<ヘイ>，声优：木内秀信、入野自由(幼年))
本作主角，20岁出头的青年。有“黑之死神”之称，武艺高超、自由操纵电流的契约者，梅西耶编号BK201。隶属“组织”设在东京的一个特工小队，代号“黑”，本名不明。战斗时通常以戴着面具的黑色风衣形象出现，常用武器是飞索钢丝和两把双刃刀。平日伪装成敦厚善良的中国人留学生李舜生(李舜生(リ・シェンシュ ン))，居住在海月庄公寓。天生大胃王，擅长中华料理。业余爱好是观星。
性情冷淡。待在组织内的唯一目的就是寻找五年前在南美洲失踪的妹妹，除此之外没有别的生活信念。随着与形形色色的人和事接触增多，性格渐趋温和，更和小队的另外三人产生了同伴意识。
其契约者能力实际是继承自妹妹，而自身并非自成的契约者，也无须支付代价。
除电击以外，更可发动量子水平物质变换的高阶能力，并借由流星碎片的增幅从“门”内引发广域不可侵入空间。因持有这一能力而成为“东京大爆炸”的关键人物。
在“东京大爆炸”的最后时刻选择了契约者和人类共存的“第三条道路”，而后和银一起叛离组织。