黄发的人物角色
特纳西·塔科特(ツナシ・タクト，另譯：津名志・拓人，声：宫野真守)
身份：南十字学园高中部一年级生(一年A班)
发色：红
瞳色：深红
印记：“印”
印记属性：战士
阶段：第三阶段“银河美少年”
拥有赛巴迪：“塔班(Tauburn)”
拥有星之剑：“Emerald(绿宝石)”、“Sapphire(蓝宝石)”
本作主角，15岁，性格开朗乐观，为了找到父亲且揍他一拳而来到南十字岛。
接受祖父未传给父亲特纳西·特奇欧的印记“印”，胸前有驯化赛巴迪的“X”字型印记，可驾驶赛巴迪“Tauburn”，初登场时即达到第三阶段“银河美少年”。
动画第16话时说明，胸前的“X”型伤痕为小时候为追求梦想而受的伤。
第25话为阻止特纳西·特奇欧利用“Samekh”实现时间循环而与之战斗并将其击败，之后为救出新藤·须方而破除扬卷·和子的印记，驾驶“Tauburn”飞出零之空间击败“Samekh”。
与新藤·须方和扬卷·和子三人是朋友，但恋爱关系暧昧。
扬卷·和子(アゲマキ・ワコ，声：早见沙织)
身份：南十字学园高中部一年级生(一年A班)
隐藏身份：“皆水的巫女”
发色：黄
瞳色：棕
印记：“钩”
印记属性：巫女
拥有赛巴迪：“Wauna”
性格开朗，喜欢唱歌，动画于第1话救了奄奄一息的塔科特。
封印赛巴迪的四方巫女之一“皆水的巫女”，是唯一公开身份的巫女，只要印记在身都不能离岛。
与特纳西·塔科特和新藤·须方是好朋友，但恋爱关系暧昧，也是须方的婚约候补人之一。
小时候梦想成为歌手，但在驯化并得到赛巴迪的记忆后放弃，直到与塔科特交心后，才再次开始唱自己喜欢的歌。
第25话为帮助塔科特而驾驶赛巴迪“Wauna”，“Shinpathy”被破坏后特纳西·塔科特为救出新藤·须方而将其破除印记。
第25话最后有表明自己同时对两个人有好感。
津云(ツクモ，TSUKUMO，声：远藤绫)
贰号艇的战斗员，3月2日生、16岁、A型，身高159cm，淡金发紫眼。平门的下属，轮之第二艇队员。身形看似柔弱，实际上十分擅长格斗。性格认真具有责任感，平日里沉默少言，在听到要对平门不利的言论时却会挺身而出，关心着无的安全，憧憬著伊娃那样的开朗个性。为了保护无被夏切和麒春捉住，后被嘉禄放走。能力是操纵多个星形物。
与仪(與儀(ヨギ)，YOGI，声：宫野真守)
贰号艇的战斗员，2月11日生、21岁、B型，身高181cm，金发紫眼。平门的下属，轮之第二艇队员。性格直爽阳光，但常常因为一些问题发言而让人觉得他有点轻浮，属于搞笑派。虽然已是成年人，但个性仍然和小孩子一样，喜欢玩游戏(例如：捉迷藏)，也常跟人拥抱(多半是无和花砾)，当无和花砾到壹组时，也流露出小孩子朋友被抢走的态度，另外也是个典型的爱哭鬼，害怕烛医生以及灵异事物，也不喜欢战斗。因为扮演喵莉娜而非常喜欢小孩子。和无、花砾相遇后成为同伴，时常与他们行动，对无非常照顾，曾对于花砾没有叫过自己的名字以及没有回他简讯而耿耿于怀。登场台词为：“充满男子气概，热血沸腾的耀眼王子”，武器是可以自由伸缩的玫瑰花式剑，必杀技为“蔷薇之墙”。另外有被人所惧怕的神秘力量，左脸贴著的创可贴脱落的话会暴走，发色变成银色性格也跟着改变。出生于偏远的小国，实际上身份是一名王子，有一个名为缪玛丽的妹妹。在10岁那年与仪的国家被能力者入侵，所有人员遭到杀害，只有与仪被抓去实验，因为王族血缘和“摇篮”很接近，所以与仪不但没有变成能力者，反而从身体里分裂出另一个人格(也就是银发与仪)。
藤原宁宁音(藤原 寧々音(ふじわら ねねね)，Fujiwara Nenene，声：尤加奈)
目前唯一还存在的前CØDE:BREAKER，刻的姐姐，零及樱的学校的学生会副会长。和刻一样拥有虹膜异色症，但戴上了眼镜而难以察觉，对小樱的胸部情有独钟(一个叫小左一个叫小右)。过去为了保护刻被杀害，目前仍活着的原因不明，处于异能丧失的状态，不知道刻是他弟弟。
在潘朵拉之盒开启后，能力再度恢复，也是伊甸真正的JOKER之一。为CØDE:BREAKER时，没有戴眼镜，冷酷无情的杀人兵器才是她的本性，但却仍然疼爱刻。
异能：
磁力: 刻的异能是她分一半给他的。但同时也将自身的生命分一半给他，因为异能等于是异能者的生命力。(但实际上是刻将异能分给了宁宁音)
异能丧失型态：返回童心
南春香(南 春香(みなみ はるか)，配音员：佐藤利奈)
南家的大姐，高中二年级学生。千秋称呼她为“春香姐姐大人”(ハルカ姉様)。由于要姊代母职，培育出十分认真的性格，特别是家务和烹饪方面。天天把家里和学校打扫得干干净净。作为烹饪能手，她主理南家一切伙食。但本性其实相当慵懒，在其他方面显得十分随便。在学校中除了学业、运动皆表现优异外，也深得师长信任。为了料理家事而未能投入课外活动，特别是具有相当潜质和实力的排球。由于本人没有经验，对于男女性别之间的话题会显得十分在意，而两位妹妹提到时亦会显得尴尬、借机回避。在初中时代担任班长时留下了各种传说，因而被尊称为“初代番长”。拥有超强的吹泡泡糖的能力，可以在泡泡中再吹出一个泡泡，此技巧被夏奈和千秋誉为“神技”(神のした技)。似乎不擅长认路。
南千秋(南 千秋(みなみ ちあき)，配音员：茅原实里)
南家的三妹，小学五年级学生，星座是天秤座。在老师家访带来的健康状况表上被形容为“总是一脸想睡样”(常に寢むそう)，心电图种类是“异常类”，是个毒舌女，成绩优秀，经常把显出单纯幼稚的人称呼作“愚蠢家伙/白痴低能”，而且不会认真看愚蠢家伙的脸。这性格使她几乎对每一位同学都显得不友善。眼睛呈半合状态，是为了不要看见不想看到的东西。对春香十分尊敬到甚至不允许任何其他人对春香流露情感的程度，而对和父亲有类似感觉的藤冈也有好感。擅长替别人取称号，却容易忘记，自称为“公主”(姫)，但不希望其别人如此叫她。虽然常常在看一些深奥的书，但中间也会流露小学生的一面。虽然称夏奈为笨蛋，但是其实是喜欢跟她一起玩和研究事物。一直深信圣诞老人存在，但某年揭破是表哥假扮时曾一度大失所望，后来夏奈找藤冈假扮才重燃其希望。曾被夏奈作成晴天娃娃，意外发现拥有可以让雨停的能力，不懂游泳，讨厌红萝卜、青椒等有色蔬菜。初吻在漫画第12话(动画第一话)就被夏奈夺去了。
今川义明(今川 義明(いまがわ よしあき)，声：奈良彻(日本);
生死情况：死亡
24岁。坂本的第一个对手，以石块杀了受重伤的大久保赖道夺取芯片后，被坂本用计时式BIM所杀，初始BIM为“撞击式”。2枚芯片被上杉谦野捡走。
风林寺碎牙(風林寺 砕牙(ふうりんじ さいが))
代号“一影”。风林寺美羽的父亲，风林寺隼人的儿子，秋雨的好友。母亲是俄罗斯裔，拥有遗传自母亲的金发。[1]是梁山泊最后一名达人。因为暗鹗众最强的首领-穿彗某些原因亲手杀了自己的妻子而隐身等待复仇，同时穿彗假扮砕牙成为一影九拳的一影。
在医术上也有一定的造诣，治疗上的手法和秋雨非常相似。曾易容为一名三脚猫佣兵藏身于提达特王女身旁，在兼一等人遇上危机时挺身而出，能用手指卡住多位达人的拳头。在解决了危机后就消失，只留下一句给兼一的话：“你这样的男人，值得信赖。”最后在提达特王国内乱平息之时，于远处的城墙上遥望着自己亲人的身影后离开。自此便开始假扮政府官员冈本，现出真身并对穿彗复仇。对于穿彗的所作所为非常的愤怒，因为深深的相信并且托付身后的人竟然就是造就这一切的凶手，并怒吼“我不会用数字去衡量生命，但是我决不会将世界交给心智扭曲的人”。到最后明白穿彗的心情，亦猜测到穿彗应该是被栉滩美云所怂恿。两人在最终仿佛回到了最初相遇的岁月那般，对于穿彗选择自裁感到深深的无力。
在落日失败之时看着父亲从天而降的身影，唯有抱以无奈的苦笑：“最终仍是敌不过你啊。”然而，打这之后便没有下文。似乎对兼一作为美羽的伴侣颇为认同。在兼一和美羽结婚后因育有一女升格当外祖父
风林寺隼人(風林寺 隼人(ふうりんじ はやと))
声优：日本：有川博(TV动画)→藤本让(OVA);
年龄不详・身高超过两公尺・体重超过100公斤。风林寺美羽的祖父，风林寺碎牙的父亲。别名：我流X。
实力是达人中的达人，从来没有输过，名声响遍整个武术界，凭著少年时的血气方刚，每天到处找人踢馆，不小心把五百多个武林高手打的半死。
在尝过胜利的美味后，一直不断的找人挑战，过著永不止息的踢馆生活，到达孤独的颠峰后，发现那里什么都没有，回神的时候已经变成老头子了。常游走各地进行“矫正世界之旅”，在美羽少时更会带著她去。在途中认识了阿帕查并让他跟随回梁山泊。可以用力气直接将战车翻转。
非常喜欢鸟兽戏画，经常花巨额收藏、使得梁山泊的财政陷入困难。在单行本61卷的后日谈中与栉滩美云见面，并要求对方请自己吃红豆汤圆冰。
也有在该作作者的另一个作品《常磐来也》中客串出场。
神代芙拉(神代 フラウ(こうじろ ふらう)，声：名冢佳织(日本);赖芸芬(香港))
年齢：16歳。生日：2002年6月17日。血型：B型。身高：156cm。三围：77-58-78。
本作女主角之一。中央种子岛高校情报处理科2年1组。从私立金丝雀学园高校转来的转学生。
又腐又宅且口无遮拦，集家里蹲御宅族的缺点于一身。不仅在网络上，在现实中也会使用大量的网络用语。兴趣是对男性间的同性恋进行妄想。对弱气的女性也有着相当大的兴趣。
拥有2000万以上玩家的机器人格斗网络游戏——KILLBALLAD的程序设计师。神代芙拉是作为程序设计师的笔名，原名是古郡可娜(ふるごおり こな)。
因一次死歌的对战与海翔相遇并产生兴趣，为找寻海翔而搬到种子岛后将废弃的旅馆买下并改装后在里面生活。转学第二天以来就没上过学。因为喜欢冷的地方和防止大型计算机的过热，房间里一直开着冷气。生活上相当邋遢。有着隐藏的傲娇属性，常以家里蹲模式来混过去，喜欢着海翔，初吻献给海翔(海翔的初吻被夺去)。
在钢巴雷尔制作计划中担任姿势控制系统和操作系统的程序设计师。
母亲任职之前大热机器人动画“机动执事钢巴雷尔”(機動バトラー ガンヴァレル)监督，在芙拉十岁时失踪。经芙拉调查后，怀疑整个动画剧组受人洗脑，致动画最终回情节与Project ATOM内容相近。整组人员在最终回前被杀害，而知道内情的监督，在后来网络流出的最终回的样稿中留下线索。
芙蕾雅・布兰(フレア・ブラン，Fleur Blanc) CV：大桥彩香(日本);杨凯凯(台湾)
“斑衣笛手”的IFO少女驾驶员。16岁。左撇子。蓝色世代社长的独生女。
有作为优秀的飞行员的自觉和骄傲，认真好胜，但偶尔都彰显可爱的一面。
过去因事故与母亲重伤濒死，在两个只能活一个的情况下被选择，对父亲没帮助母亲的事心存愤怒。但是，其后来得悉父亲在任务背后的各种支持，对抗的心态亦逐渐软化。在父亲牺牲自己时，她终于表露出日久未见的伤心，毅然在作战前线的同时，兼任父亲的职务。
起初对经常一击歼灭Secrets的苍存有对抗和嫉妒的心，不停以前辈的身份自居。后来发现苍在对抗父亲和坚持已见方面跟自己近似，渐渐智趣双投，成为一队愉快地争吵的冤家，亦是众人关系中最坚稳的。曾因此被爱莲娜和爸爸怀疑已成为恋人，但本人矢口否认，只是在苍跟艾蕾卡相遇时还是有点儿吃醋。后来因爱莲娜也插手于二人关系当中，所以为此吵了一场大架，却又因此逐渐理解众人的心态，决定以后都要三人并肩努力。在苍决意堕入时空缝隙前作为最后一位告别，却因为听不到最后一句而在泪水中留着近乎永远的遗憾。
曾经对瞪羚有一些情结，后来被认为是一种对父亲的渴望。