游戏本传《绯色的碎片》系列
故事主角春日珠纪因父亲调到非洲工作，因此她被叫到外祖母家所在的季封村去，和外婆一起生活。被叫去的真正原因是因为一把名为“鬼斩丸”的刀因某种原因封印开始减弱，而导致村里的神明纷纷骚动了起来，又因主人公的体内流着玉依血脉，被称为“玉依姬”，而玉依姬自太古以来代代都继承著封印“鬼斩丸”的使命。
同时，五位被称为“守护者”守护玉依姬的少年们出现了。游戏中就是描写珠纪在对抗阻止封印的谜样组织逻格斯的过程中，和“守护者”之间产生的恋情。
游戏本传爱藏版《绯色的欠片 茜色的追忆》，追加游戏本传的部分剧情补述。附加外传作品《绯色的碎片 在那片天空下》则交代“鬼斩丸”被封印后，珠纪正式继承玉依姬身份和其他守护者们的互动，并分别经历情人节和秋祭（DS游戏版则追加圣诞节篇章）的事件。
《翡翠之雫 绯色的碎片2》系列
该作故事设定于鬼斩丸封印半年后，一座被高山围绕的沿海村落－锦律见村，主角高千穗珠洲是居住于锦律见村的水杜珠洲学院高中2年级学生，历代负责守护海神神社的最高位海神巫女“玉依姬”的继承者。长年以来，锦律见村的“玉依姬”肩负着祭奉龙神的使命，维护着锦律见村的和平。直至剧情初始时，龙神因故发狂，开始在锦律见村兴风作浪，珠洲的母亲暨先任玉依姬高千穗彩子为平息龙神的愤怒，牺牲自己的生命，连珠洲的义姊八坂真绪亦于抢救珠洲的过程中，不慎遭海啸卷入海里，虽然珠洲为母亲和义姊的遭遇感到哀伤，但还是强忍丧亲之痛，继承母亲的遗志成为继任玉依姬。
历劫归来的真绪再度和珠洲相会，但此时的真绪不仅性情丕变，沾染污浊的邪气，甚至还威胁珠洲将象征最高位海神巫女“玉依姬”的证明“玉依姬的勾玉”亲手交给她，否则将对其不利，转而动身离开珠洲的面前。为了寻回真绪并发掘后者产生异变的实情，珠洲决定踏上旅程，还陆续邂逅几名拥有特殊力量，被称为“守护者”的少年，进而和“守护者”谱出恋情。
本作关于玉依姬和守护者的世界观和历史设定有别于《绯色的碎片》和《白华之槛》，其攸关于丰玉姬和玉依姬的叙述，系取材于日本神话丰玉姬分娩并托子于玉依姬的典故。在《绯色的碎片》登场的珠纪和守护者们，将以协助者的身份客串登场。
《真·翡翠之雫》则是《翡翠之雫》经过剧情重制的游戏版本，在DS版附有“桃花祭”的后日谈结局。
《苍黑之楔 绯色的碎片3》系列
《苍黑之楔》的剧情背景，建立于“鬼斩丸”被封印一年后的夏天，季封村产生的异变忽然袭向珠纪和守护者们，为了查明幕后的真相，珠纪等人决意再次迎接挑战并阻止世界的毁灭。DS平台的游戏版本，附有“红陵祭”的后日谈剧情，叙述珠纪和众角色们参加红陵学院文化祭的经过。
外传资料片《苍黑之楔 迎向明天》补充说明《苍黑之楔》事件落幕后的翌年春天，通过应届入学测验的珠纪和守护者们接获大学的录取通知，面临即将来临的毕业典礼和生活变化，众人进而流露彼此间的心路转折，终结自《绯色的碎片》本传起始的系列故事。剧情模式共分为“大家的结业式”和“与你的结业式”两个篇章，“大家的结业式”为众角色的共同故事线，依据主人公的选择令剧情产生些许变化；“与你的结业式”系承续《苍黑之楔》和指定角色发展出Goodending后的续篇故事线，为主人公和个别角色的恋情作出总结。
《白华之槛 绯色的碎片4》系列
故事背景建立于距离《绯色的碎片》千年前的平安时代，该作主角词纪系当代肩负守护和封印鬼斩丸使命的“玉依姬”，因为幼年时期身为先任玉依姬的母亲卯纪之死，深陷咎责之情而无法从过去的囚梏解脱。然而随着其和“守护者”们的邂逅和相恋，词纪的命运亦逐步产生了变化。《白华之槛》的游戏本片共有15种结局，每位可攻略对象个别有Bad ending、Normal ending、Good ending的结局模式，其中仅有一个结局承接《绯色的碎片》和《苍黑之楔 绯色的碎片3》系列的历史设定。
附属外传《白华之槛 四季之诗》，则是额外描述词纪在世界恢复和平后，和其他守护者互动所发生的故事。《四季之诗》分为“春”、“夏”、“秋”、“冬”四个篇章，部分原本于《白华之槛》无法攻略的角色，将于《四季之诗》成为可攻略的对象。
该作是《绯色的碎片》和《苍黑之楔 绯色的碎片3》系列的前传，并补充说明部分《绯色的碎片》和《苍黑之楔 绯色的碎片3》登场角色的祖先的经历。
《绯色碎片 新玉依姬传承》系列
主角藤森沙弥是居住于寒名市的高中2年级学生，原本过着极其平凡的生活。某个月夜，沙弥偶然和名为鬼崎刀真的持刀少年相遇，之后却经常发现无人查觉的诡异气息和谜样生物，加上几名神秘的少年们不断地接近她，令其深陷苦恼之中。后来沙弥在险遭不明生物袭击之际，被先前于月夜里邂逅的刀真所救，以刀真为首、集结在现场的五名少年，宣称沙弥正是他们负责守护的“玉依姬”，而他们则是随侍在玉依姬身边的“守护者”，环绕在沙弥和守护者之间的冒险故事就此展开。
《新玉依姬传承》是绯色碎片系列里，唯一将剧情背景设定于现代都市的作品。守护者皆由《绯色的碎片》的配音员担纲演出。
动画剧情
某一日，平凡的女生春日朱纪(三宅麻理惠 配音)在回老家的途中遭到了魔物的攻击，索性被少年鬼崎拓磨(杉田智和 配音)所救。之后，惊魂未定的朱纪被祖母告知，长久以来，村中封印着一把名为“鬼斩丸”的妖刀。而此刻，妖刀的魔力开始渐渐苏醒，从而吸引了大量魔物前来聚集。作为“玉衣”的唯一后人，朱纪拥有着将妖刀再次封印的能力和责任，为此，一场华丽的冒险就此展开。
在朱纪的身边，出现了被称为“守护五家继承人”的男子们，保护朱纪的安全，就是他们的职责所在。除了鬼崎拓磨之外，还有傲娇自负的鸦取真弘(冈野浩介 配音)，冷静温柔的狐邑祐一(浪川大辅 配音)，年长可靠的大蛇卓(平川大辅 配音)等人。在斩妖除魔的同时，朱纪也和这些可靠的保护者们产生了深深的羁绊。
